Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad54bQ6PFE3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms