Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf8Q60846 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms