Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx33Q4VAA7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx33Q4VAA7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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