Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnpc3Q3UZ01 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms