Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
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