Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms