Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Runx1Q03347 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Runx1Q03347 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms