Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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