Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms