Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm2P58774 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms