Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BrafP28028 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BrafP28028 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BrafP28028 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BrafP28028 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BrafP28028 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BrafP28028 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BrafP28028 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BrafP28028 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BrafP28028 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BrafP28028 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BrafP28028 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BrafP28028 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BrafP28028 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BrafP28028 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BrafP28028 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BrafP28028 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms