Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl3P27659 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms