Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TP20293 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TP20293 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TP20293 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TP20293 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TP20293 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TP20293 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TP20293 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TP20293 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TP20293 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TP20293 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TP20293 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TP20293 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TP20293 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP20293 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP20293 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP20293 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP20293 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms