Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Becn2P0DM65 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms