Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp8O89110 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms