Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3aO70157 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top3aO70157 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms