Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPB9F8W1W9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms