Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms