Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb3D3Z6J4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms