Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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