Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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