Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LHX9Q9NQ69 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms