Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SPOCK3Q9BQ16 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms