Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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FAM3DQ96BQ1 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
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FAM3DQ96BQ1 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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FAM3DQ96BQ1 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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FAM3DQ96BQ1 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM3DQ96BQ1 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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