Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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GEN1Q17RS7 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GEN1Q17RS7 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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GEN1Q17RS7 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GEN1Q17RS7 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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GEN1Q17RS7 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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GEN1Q17RS7 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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GEN1Q17RS7 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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GEN1Q17RS7 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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GEN1Q17RS7 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GEN1Q17RS7 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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