Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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