Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USF2Q15853 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USF2Q15853 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USF2Q15853 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USF2Q15853 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USF2Q15853 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
USF2Q15853 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USF2Q15853 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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