Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC85BQ15834 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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