Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMAD1Q15797 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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