Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
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HMGN3Q15651 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
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HMGN3Q15651 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
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HMGN3Q15651 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HMGN3Q15651 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
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HMGN3Q15651 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HMGN3Q15651 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
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