Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDSNQ15517 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.7 ms