Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SF3B3Q15393 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B3Q15393 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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