Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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UBE3CQ15386 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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UBE3CQ15386 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
UBE3CQ15386 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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