Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NKX1-1Q15270 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NKX1-1Q15270 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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