Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KARSQ15046 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KARSQ15046 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KARSQ15046 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KARSQ15046 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KARSQ15046 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KARSQ15046 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KARSQ15046 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KARSQ15046 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KARSQ15046 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.17
KARSQ15046 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KARSQ15046 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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