Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RRP1BQ14684 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RRP1BQ14684 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms