Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCINQ13939 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCINQ13939 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCINQ13939 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCINQ13939 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCINQ13939 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCINQ13939 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCINQ13939 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCINQ13939 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCINQ13939 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms