Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL3Q13618 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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