Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
BFSP2Q13515 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BFSP2Q13515 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BFSP2Q13515 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BFSP2Q13515 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
BFSP2Q13515 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BFSP2Q13515 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BFSP2Q13515 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BFSP2Q13515 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BFSP2Q13515 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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BFSP2Q13515 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
BFSP2Q13515 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BFSP2Q13515 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
BFSP2Q13515 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
BFSP2Q13515 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
BFSP2Q13515 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BFSP2Q13515 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BFSP2Q13515 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BFSP2Q13515 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BFSP2Q13515 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
BFSP2Q13515 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
BFSP2Q13515 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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