Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SMAD4Q13485 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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