Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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TOP3AQ13472 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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TOP3AQ13472 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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TOP3AQ13472 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TOP3AQ13472 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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