Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
XRCC4Q13426 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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