Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PPFIA1Q13136 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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