Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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