Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
BNIP1Q12981 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BNIP1Q12981 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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