Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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NFIAQ12857 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NFIAQ12857 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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