Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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PGGT1BP53609 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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PGGT1BP53609 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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PGGT1BP53609 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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PGGT1BP53609 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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PGGT1BP53609 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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PGGT1BP53609 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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PGGT1BP53609 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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PGGT1BP53609 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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PGGT1BP53609 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP53609 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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