Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TSPOP30536 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
TSPOP30536 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TSPOP30536 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TSPOP30536 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms