Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPREP23469 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPREP23469 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPREP23469 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPREP23469 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPREP23469 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPREP23469 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPREP23469 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPREP23469 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPREP23469 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPREP23469 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPREP23469 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPREP23469 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPREP23469 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPREP23469 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPREP23469 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPREP23469 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPREP23469 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPREP23469 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPREP23469 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPREP23469 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPREP23469 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPREP23469 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPREP23469 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPREP23469 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPREP23469 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPREP23469 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPREP23469 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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