Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
IRGMA1A4Y4 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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